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Interaktom: Unterschied zwischen den Versionen
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Als '''Interaktom''' wird das Gesamtnetzwerk aller molekularen Wechselwirkungen in einer [[Zelle (Biologie)|Zelle]] bezeichnet, wobei der Begriff aber oft auf die Wechselwirkungen zwischen den [[Protein]]en eines [[Proteom]]s | Als '''Interaktom''' wird das Gesamtnetzwerk aller molekularen Wechselwirkungen in einer [[Zelle (Biologie)|Zelle]] bezeichnet, wobei der Begriff aber oft auf die Wechselwirkungen zwischen den [[Protein]]en eines [[Proteom]]s - also auf das ''Protein Interaction Network'' (PIN) - eingeschränkt wird<ref>Gavin C. K. W. Koh, et al.: ''Analyzing Protein–Protein Interaction Networks.'' In: Journal of Proteome Research 2012 11 (4), 2014-2031 [[doi:10.1021/pr201211w]] [https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/pr201211w pdf]</ref>. | ||
Die Größe des Interaktoms wurde auch als Maßstab für die Komplexität eines Organismus vorgeschlagen. Michael P. H. Stumpf et al.<ref>Stumpf M, Thorne T, et al.: ''Estimating the size of the human interactome.'' [[Wikipedia:PNAS|PNAS]], 2008, 105(19): 6959 [[doi:10.1073/pnas.0708078105]] [http://www.pnas.org/content/105/19/6959.full.pdf pdf]</ref> schätzen, dass das menschliche Interaktom ungefähr 25.000 Proteine und 650.000 Protein-Wechselwirkungen umfasst, von denen derzeit weniger als 0,3 % bekannt sind <ref>L.A. Amaral: ''A truer measure of our ignorance.'' In: [[Wikipedia:PNAS|PNAS]], 2008, 105(19):6795 [[doi:10.1073/pnas.0802459105]] [http://www.pnas.org/content/105/19/6795.full.pdf pdf]</ref>. | Die Größe des Interaktoms wurde auch als Maßstab für die Komplexität eines Organismus vorgeschlagen. Michael P. H. Stumpf et al.<ref>Stumpf M, Thorne T, et al.: ''Estimating the size of the human interactome.'' [[Wikipedia:PNAS|PNAS]], 2008, 105(19): 6959 [[doi:10.1073/pnas.0708078105]] [http://www.pnas.org/content/105/19/6959.full.pdf pdf]</ref> schätzen, dass das menschliche Interaktom ungefähr 25.000 Proteine und 650.000 Protein-Wechselwirkungen umfasst, von denen derzeit weniger als 0,3 % bekannt sind <ref>L.A. Amaral: ''A truer measure of our ignorance.'' In: [[Wikipedia:PNAS|PNAS]], 2008, 105(19):6795 [[doi:10.1073/pnas.0802459105]] [http://www.pnas.org/content/105/19/6795.full.pdf pdf]</ref>. | ||
Aktuelle Version vom 19. Juli 2018, 23:08 Uhr
Als Interaktom wird das Gesamtnetzwerk aller molekularen Wechselwirkungen in einer Zelle bezeichnet, wobei der Begriff aber oft auf die Wechselwirkungen zwischen den Proteinen eines Proteoms - also auf das Protein Interaction Network (PIN) - eingeschränkt wird[1].
Die Größe des Interaktoms wurde auch als Maßstab für die Komplexität eines Organismus vorgeschlagen. Michael P. H. Stumpf et al.[2] schätzen, dass das menschliche Interaktom ungefähr 25.000 Proteine und 650.000 Protein-Wechselwirkungen umfasst, von denen derzeit weniger als 0,3 % bekannt sind [3].
Eine frei zugängliche Datenbank für Interaktom-Netzwerke, in der die bisher aufgrund entsprechender Veröffentlichungen bekannten Reaktionspfade in einem Pathway-Browser abgerufen werden können, ist beispielsweise Reactome.
Einzelnachweise
- ↑ Gavin C. K. W. Koh, et al.: Analyzing Protein–Protein Interaction Networks. In: Journal of Proteome Research 2012 11 (4), 2014-2031 doi:10.1021/pr201211w pdf
- ↑ Stumpf M, Thorne T, et al.: Estimating the size of the human interactome. PNAS, 2008, 105(19): 6959 doi:10.1073/pnas.0708078105 pdf
- ↑ L.A. Amaral: A truer measure of our ignorance. In: PNAS, 2008, 105(19):6795 doi:10.1073/pnas.0802459105 pdf
